Beşiktaş, 1998-99 sezonunda Türkiye 1. Futbol Ligi, Kupa Galipleri Kupası ve Türkiye Kupası'nda mücadele etmiştir. Beşiktaş, 1998-99 sezonunda Türkiye 1. Futbol Ligi'ni bir puan farkla ikinci bitirirken, Türkiye Kupası'nda Galatasaray'a finalde elenmiş ve UEFA Kupa Galipleri Kupası'nda ikinci turda elenmiştir. Takım kadrosu Maçlar Spor Yazarları Derneği Kupası Türkiye 1. Futbol Ligi Puan Durumu Ayrıntılı lig durumu Haftaya göre sonuçlar İlk devre İkinci devre UEFA Kupa Galipleri Kupası Birinci tur İkinci tur Atatürk Kupası Türkiye Kupası Altıncı tur Çeyrek final Yarı final Final 1998-99 Kategori:1998'de Türkiye'de futbol Kategori:1999'da Türkiye'de futbol